Corría el año 1561… y nacía Juana Zárate,la esposa del fundador de Corrientes, quien por ser hija del Adelantado Juan Ortíz de Zárate, es que constituyó a Juan de Torres y Vera de Aragón en Adelantado. Su madre era una princesa incaica, Palla Yupanqui, bautizada con el nombre de Leonor.
Corta fue la vida de Juana Zárate. Murió en Chuquisaca en el año 1587 dejando un hijo: Juan Alonso de Vera y Zárate.
En 1575 dejó de funcionar la Real Audiencia de Concepción, y el licenciado Torres de Vera y Aragón partió con destino al Perú en febrero de 1576, llegando a Charcas para desempeñar las mismas funciones que había desempeñado en Chile. En su nuevo lugar de residencia contrajo matrimonio con Juana Ortíz de Zárate, hija del Adelantado Juan Ortíz de Zárate y de una supuesta princesa incaica que había heredado los bienes y el título de su padre, dignidad nobiliaria esta que sería para quien fuera su esposo, lo que la convertía a la joven Juana en un muy buen partido. Entre los numerosos pretendientes que se presentaron eligió a Juan de Torres, con el visto bueno de su tutor y albacea Juan de Garay. Pero según las leyes de Indias, el flamante esposo, como oidor de la audiencia, no podía contraer matrimonio con alguien de la jurisdicción de esa institución y esto le provocó una serie de pleitos que le impidieron ir a hacerse cargo del adelantazgo en el territorio del Plata.
Ya en la ciudad de Asunción, según afirman algunos historiadores paraguayos, Torres de Vera y Aragón contrajo matrimonio con Doña María Arias de Mansilla y de esta unión nació un hijo, Gabriel de Vera y Aragón, que no conoció a su padre, pero tuvo destacada actuación como teniente de gobernador del Tucumán en 1621 y gobernador de Paraguay en 1632.
Luego de la fundación de la ciudad de Vera, en el viaje hacia España se detuvo en Santa Fe, donde después de hacer algunos nombramientos, encargó a los capitanes Diego de Olavarri y Sebastián de León la fundación de una población que se llamaría Nueva Estepa -en homenaje a su pueblo natal- en la boca del río Bermejo o en el lugar que les pareciera más cómodo. Este proyecto no llegó a cumplirse.
Continuó viaje a Buenos Aires donde realizó otros nombramientos, entre ellos, el de Hernando de Mendoza como teniente de gobernador de Buenos Aires, y para fin de ese año 1588 se encontraba otra vez en Charcas, desde donde dirigió un largo memorial al rey exponiendo sus servicios a la corona y pidiendo en mérito de ello el pago de sus salarios en licencias para introducir esclavos y el hábito de una orden militar para sí y para su hijo.
Se sabe que hacia fines de 1589 se encontraba en Sevilla y que sus gestiones ante la corona no tuvieron favorable respuesta. Volvió a Charcas, algunos dicen que en 1603 y otros que en 1606, estaba empobrecido y nada se sabe de sus últimos años. Se supone que murió después de 1610, se desconoce cuando y dónde están sus restos.